Только за период с 2013 по 2025 гг. опубликовано 229 научных статей, в том числе 60 статей в журналах Scopus и WofS, 4 монографии; 27 авторских свидетельств и 22 патента на сорта пшеницы, которые включены в Государственный реестр селекционных достижений. Издано более 10 учебных пособий. Основные статьи за последние 3 года:
1. Cetiner B., Shamanin V.P., Tekin-Cakmak Z.H., Pototskaya I.V., Koksel F., Shepelev S.S., Aydarov A.N., Ozdemir B., Morgounov A.I., Koksel H. Utilization of intermediate wheatgrass (Thinopyrum intermedium) as an innovative ingredient in bread making. Foods. 2023; 12: 2109. DOI: 10.3390/foods12112109.
2. Shamanin V.P., Tekin-Cakmak Z.H., Karasu S., Pototskaya I.V., Shepelev S.S., Chursin A.S., Morgounov A.I., Sagdic O., Koksel H. Phenolic content and antioxidant capacity of synthetic hexaploid wheats. Plants. 2023; 12: 2301. DOI: 10.3390/plants12122301.
3. Tajibayev D., Mukin K., Babkenov A., Chudinov V., Dababat A.A., Jiyenbayeva K., Kenenbayev S., Savin T., Shamanin V., Tagayev K. et al. Exploring the Agronomic Performance and Molecular Characterization of Diverse Spring Durum Wheat Germplasm in Kazakhstan. Agronomy. 2023; 13, 1955. DOI: org/10.3390/ agronomy13071955.
4. Koksel H., Cetiner B., Shamanin V.P., Tekin-Cakmak Z.H., Pototskaya I.V., Kahraman K., Sagdic O., Morgounov A.I. Quality, Nutritional Properties, and Glycemic Index of Colored Whole Wheat Breads. Foods. 2023; 12: 3376. 10.3390/foods12183376.
5. Geyik Ö.G., Tekin-Cakmak Z.H., Shamanin V.P., Karasu S., Pоtоtskaya I.V.,
Shepelev S.S., Chursin A.S., Morgounov A.I., Yaman M., Sagdic O., Kokse H. Effects of phenolic compounds of colored wheats on colorectal cancer cell lines. Quality Assurance and Safety of Crops & Foods. 2023; 15(4): 21-31.
6. Шаманин В.П., Потоцкая И.В., Ессе С.А., Гладких М.С., Шепелев С.С., Зуев Е.В., Виниченко Н.А., Koksel H., Моргунов A.И. Стародавние сорта пшеницы – источники высокого качества и питательных свойств зерна // Труды ВИР. 2023.
7. Shamanin V.P., Tekin-Cakmak Z.H., Karasu S., Pоtоtskaya I.V., Gordeeva E.I., Verner A.O., Morgounov A.I., Yaman M., Sagdic O., Koksel H. Antioxidant activity, anthocyanin profile, and mineral compositions of colored wheats. Quality Assurance and Safety of Crops & Foods, 2024; 16(1): 98–107. DOI: 10.15586/qas.v16i1.1414.
8. Trevisan S., Koksel F., Cetiner B., Shamanin V.P., Pototskaya I.V., Ozdemir B., Morgounov A.I., Koksel H. Incorporation of intermediate wheatgrass (Thinopyrum intermedium) into bread wheat doughs: Effects on pasting and rheological properties. Cereal Chemistry, 2024; 1–13. DOI: 10.1002/cche.10786.
9. Morgounov A., Babkenov A., Ben C., Chudinov V., Dolinny Y., Dreisigacker S., Fedorenko E., Gentzbittel L., Rasheed A., Savin T., Shepelev S., Zhapayev R., Shamanin V. Molecular markers help with breeding for agronomic traits of spring wheat in Kazakhstan and Siberia. Genes. 2024; 15: 86. https://doi.org/10.3390/genes15010086 (WoS, Q1).
10. Pototskaya I.V., Shepelev S.S., Turuspekov Y.K., Morgounov A.I., Chursin A.S., Kovalchuk A.M., Savin T.V., Shamanin V.P. Breeding and genetic evaluation of International winter wheat collection under conditions of Western Siberia. Siberian journal of Life Science and Agriculture. 2024; 6.
11. Шаманин В.П., Потоцкая И.В., Чурсин А.С., Шепелев С.С., Нардин Д.С., Пожерукова В.Е., Köksel H., Моргунов А.И. Селекция яровой мягкой пшеницы (Triticum aestivum L.) для производства экологически чистого зерна с функциональными свойствами в условиях Западной Сибири. Сельскохозяйственная биология. 2024. Т. 59. № 3. С. 492–506. DOI 10.15389/agrobiology.2024.3.492rus
12. Гордеева Е.И., Шаманин В.П., Хлесткина Е.К., Шоева О.Ю. Об особенностях селекции фиолетовозерной пшеницы на основе сортов с антоциановой окраской колеоптеля и стебля. Сельскохозяйственная биология. 2024. Т. 59. № 3. С. 507–524.
13. Shepelev S.S., Pototskaya I.V., Morgounov A.I., Chursin A.S., Esse S.A., Koshkin M.N., Shamanin V.P. Genome wide association study of landraces and modern varieties of spring bread wheat under conditions of Western Siberia. DergiPark. 2024.
14. Shepelev S., Pototskaya I., Morgounov A., Chursin A., Esse S., Koshkin M., Shamanin V. Identifying loci associated with grain quality traits of landraces and modern varieties of spring bread wheat under conditions of Western Siberia. Turkish Journal of Field Crops. 2025; 30(1): 11–21. DOI:10.17557/tjfc.1559476.
15. Потоцкая И.В., Шепелев С.С., Чурсин А.С., Ковальчук А.М., Шаманин В.П. Фенотипическая и генотипическая оценка образцов озимой пшеницы и выделенные источники хозяйственно-ценных признаков для селекции в условиях Западной Сибири // Siberian Journal of Life Sciences and Agriculture, 2025. №. 5. С.
16. Koksel H., Ozkan K., Cetiner B., Pоtоtskaya I.V., Morgounov A.I., Sagdic O., Shamanin V.P. Mineral composition, minerals bioavailability, and in vitro glycemic index values of whole wheat breads prepared from colored wheats. Quality Assurance and Safety of Crops & Foods. 2025; 17(2): 124–135. DOI: 10.15586/qas.v17i2.153.
17. Morgounov A., Shchuklina O., Pototskaya I., Aydarov A., ShamaninV. Perennial Grains in Russia: History, Status, and Perspectives. Crops 2025, 5, 46. https://doi.org/10.3390/crops5040046.
18. Shamanin V., Shepelev S., Kovalchuk A., Morgounov A., Turuspekov Y., Pototskaya I. SNP effects on yield and agronomic traits in an international winter wheat collection grown in Western Siberia. Crops. 2025, 5: 41. DOI: 10.3390/crops5040041.
19. Geyik Ö.G., Shamanin V.P., Sagdic O., Pоtоtskaya I.V., Kutlu E., Gordeeva E.I., Morgounov A., Koksel H. In vitro bioaccessibility of phenolics of whole wheat breads prepared from colored wheats and their anti-cancer effect on colorectal cells. Food Bioscience. 2025